Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tbx6P70327 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms