Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgif1P70284 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.3 ms