Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfixP70257 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfixP70257 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NfixP70257 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NfixP70257 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NfixP70257 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfixP70257 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NfixP70257 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfixP70257 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfixP70257 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfixP70257 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfixP70257 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NfixP70257 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfixP70257 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NfixP70257 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NfixP70257 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NfixP70257 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms