Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd13P70217 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms