Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SbdsP70122 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SbdsP70122 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms