Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps17P63276 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms