Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actg1P63260 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actg1P63260 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms