Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crip1P63254 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crip1P63254 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms