Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp2P63044 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp2P63044 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms