Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps3P62908 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms