Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms