Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gnb1P62874 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms