Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl23aP62751 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms