Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms