Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch1P62046 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms