Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufm1P61961 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms