Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Copz1P61924 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copz1P61924 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms