Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga11P61622 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga11P61622 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.5 ms