Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnd3P61588 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms