Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims4P60191 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms