Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl3P58873 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl3P58873 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms