Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp2c40P56657 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c40P56657 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms