Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctbp2P56546 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms