Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp5P56399 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp5P56399 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp5P56399 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp5P56399 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp5P56399 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms