Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pex2P55098 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pex2P55098 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pex2P55098 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms