Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rad23bP54728 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad23bP54728 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms