Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux1P53564 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux1P53564 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux1P53564 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux1P53564 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux1P53564 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms