Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp10P52479 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp10P52479 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp10P52479 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp10P52479 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms