Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CastP51125 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CastP51125 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CastP51125 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CastP51125 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CastP51125 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CastP51125 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CastP51125 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CastP51125 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CastP51125 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CastP51125 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CastP51125 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CastP51125 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CastP51125 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CastP51125 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CastP51125 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CastP51125 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CastP51125 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CastP51125 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CastP51125 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CastP51125 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CastP51125 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CastP51125 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CastP51125 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CastP51125 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CastP51125 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CastP51125 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CastP51125 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CastP51125 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CastP51125 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CastP51125 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms