Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp9P49962 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srp9P49962 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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