Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms