Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VdrP48281 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VdrP48281 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VdrP48281 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VdrP48281 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VdrP48281 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VdrP48281 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VdrP48281 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VdrP48281 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VdrP48281 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VdrP48281 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VdrP48281 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VdrP48281 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VdrP48281 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VdrP48281 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VdrP48281 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VdrP48281 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VdrP48281 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms