Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rplp1P47955 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms