Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax9P47242 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms