Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax7P47239 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pax7P47239 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax7P47239 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax7P47239 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax7P47239 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax7P47239 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax7P47239 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax7P47239 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms