Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brcc3P46737 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms