Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syt1P46096 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt1P46096 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms