Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms