Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf9P41274 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf9P41274 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms