Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LtbP41155 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LtbP41155 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LtbP41155 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LtbP41155 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LtbP41155 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LtbP41155 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LtbP41155 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LtbP41155 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LtbP41155 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LtbP41155 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms