Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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