Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VhlP40338 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VhlP40338 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VhlP40338 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VhlP40338 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VhlP40338 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms