Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf1P39428 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf1P39428 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf1P39428 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf1P39428 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf1P39428 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms