Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lig1P37913 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lig1P37913 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms