Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprkP35822 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprkP35822 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprkP35822 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprkP35822 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprkP35822 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprkP35822 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtprkP35822 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprkP35822 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprkP35822 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprkP35822 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprkP35822 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprkP35822 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms