Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc5P32043 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms