Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa11P31311 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa11P31311 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa11P31311 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hoxa11P31311 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms