Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msr1P30204 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msr1P30204 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms