Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Pabpc1P29341 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc1P29341 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms