Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprmP28828 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprmP28828 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprmP28828 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprmP28828 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprmP28828 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprmP28828 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
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